A Dunaújvárosi Egyetem alábbi szervezeti struktúra szerint működik.

Szervezeti struktúra (ORGANOGRAM) 

Szervezeti egységek

• Dunaújvárosi Egyetemért Alapítvány
  • Kuratórium
  • Felügyelőbizottság
  • Adatok, elérhetőség
• Közhasznúsági Felügyelőbizottság
• Vezető testületek
  • Szenátus
• Rektor
  • Kabinet
    • Stratégiai Kapcsolatok Igazgató
      • Társadalmi Kapcsolatok Központ
    • Jogi Iroda
    • Minőségirányítás
    • Kommunikációs Központ
      • Komptencia Központ
  • Intézményfejlesztési és általános rektorhelyettes
  • Oktatási rektorhelyettes
    • Felsőoktatási igazgató
      • Tanulmányi Hivatal
      • Duális Képzési Központ
    • Nemzetközi Kapcsolatok Igazgatósága
  • Tudományos és Kutatási Rektorhelyettes
    • Ipari Fejlesztési Központ
    • Pályázati Iroda
    • Nukleáris Igazgatóság
      • Nukleáris Tudásszolgáltatási Platform
    • DUE Paksi Kompetencia- és Kutatóközpont
  • Oktatási szervezeti egységek
    • Műszaki Intézet
      • Gépészeti és Energetikai Tanszék
      • Szerkezeti Integritás Tanszék
    • Informatikai Intézet
      • Szoftverfejlesztési és Alkalmazási Tanszék
      • Matematika és Számítástudományi Tanszék
      • Számítógéprendszerek és Irányítástechnikai Tanszék
    • Társadalomtudományi Intézet
      • Gazdálkodástudományi Tanszék
      • Szervezetfejlesztési és Kommunikációtudományi Tanszék
    • Tanárképző Központ
      • Online Studium
  • Belső ellenőr
• Gazdasági Főigazgató
  • Pénzügyi és Számviteli Iroda
  • Munkaügyi Iroda
  • Közbeszerzés
  • Kontrolling
  • Közérdekű adatok
    • Hivatalos intézményi adatok
• Műszaki és Szolgáltatási Igazgató
  • Családbarát Szolgáltató
  • Kerpely Antal Kollégium
  • Könyvtár és Információs Központ
    • Jegyzetbolt
    • Fordítóiroda
  • Műszaki Szolgáltató Központ
• Dunaújvárosi Felsőoktatásért Alapítvány
• DUE Sportegyesület
• Ecotech Nonprofit Zrt.
• Kerpely Kollégium Fejlesztési és Oktatási Alapítvány
• Dunaújvárosi Egyetem Bánki Donát Technikum